食品中的微生物可以使用ATP熒光檢測儀防治，判斷食品的衛生情況。食品的微生物污染屬于生物性污染，大多是指食品受到外界微生物的污染。引起食品中的微生物種類有很多，如細菌、霉菌等，微生物可以通過各種直接或間接的方式進入食品中，并不斷的在食品中生長繁殖，較終引起食品的腐敗變質。由于微生物分布廣泛，繁殖速度快，適應能力強，所以在自然界中的土壤、空氣、水體、動物體內都廣泛存在，不同的環境中其微生物的種類也有所不同。
食品在生產、加工、孕畜、儲藏及銷售的等一系列過程中都有可能遭受到微生物的污染，主要是通過水體、空氣、人及動物、用具及雜物中微生物污染。雖然我們會使用ATP熒光檢測儀檢測食品中的微生物含量，避免其影響到人體的健康，但是微生物污染會導致食品的腐敗變質，較終會影響到食品市場的收益，那么我們應該如何防治食品微生物的污染產生呢？
由于微生物的污染途徑不同所以才去的防治措施也會有所不同。食品受到微生物污染主要有食品加工前、食品加工過程中及食品加工后，為了確保食品的衛生質量，首先需要確保食品中的原料微生物含量的減少，加強環境衛生、食品衛生的監督管理，隨時采用食品微生物檢測儀對食品及加工環境進行檢測。其次要做好污水及垃圾的管理工作，環境衛生對于食品的影響很大，而這也是我們常常忽略掉的一點。同時還要確保食品包裝材料以及運輸工具、銷售環境的衛生質量情況，及時監督檢測，確保環境安全衛生。
